268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2417 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  100 
 
 
235 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  74.11 
 
 
232 aa  326  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  72 
 
 
232 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  73.52 
 
 
232 aa  308  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  66.52 
 
 
232 aa  299  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  59.91 
 
 
223 aa  241  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  61.79 
 
 
233 aa  238  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  61.79 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  57.08 
 
 
219 aa  228  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  55.07 
 
 
271 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  55.61 
 
 
232 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  56.1 
 
 
235 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  55.14 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  55.12 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  56.59 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  51.98 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  55.9 
 
 
222 aa  193  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  50.63 
 
 
245 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  54.72 
 
 
294 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  51.87 
 
 
233 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.93 
 
 
453 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  48.9 
 
 
248 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.89 
 
 
408 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  45.18 
 
 
260 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  47.69 
 
 
246 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  48.61 
 
 
246 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  48.31 
 
 
261 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  38.07 
 
 
231 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  34.06 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  31.15 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  37.68 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  31.06 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  30.43 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  37.61 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  41.05 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  31.41 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  29.81 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  39.22 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  40 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  39.22 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  37.36 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  41.05 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  32 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  31.5 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  31.5 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  40 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  32 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  40 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  40 
 
 
231 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  34.59 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  31 
 
 
278 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  31.5 
 
 
273 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  31 
 
 
273 aa  62  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  39.78 
 
 
229 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  37.63 
 
 
238 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  39.78 
 
 
229 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  31 
 
 
273 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  32 
 
 
273 aa  61.6  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  31 
 
 
273 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  37.89 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  38.3 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  31.25 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  38.3 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  38 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  37.89 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  37.89 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  29.8 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  39.58 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  37.63 
 
 
229 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  33.33 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  33.33 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  31.31 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  34.65 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  37.63 
 
 
228 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  31.15 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  29.05 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  37.63 
 
 
229 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  39.78 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  31.33 
 
 
239 aa  58.5  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  39.13 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  31.87 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  38 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  32.45 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  39.78 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  40.22 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  31.69 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  36.96 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  36.96 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  36.96 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  32.04 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  36.96 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  40.18 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  27.71 
 
 
315 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0516  major intrinsic protein  40.43 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  36.96 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  37.63 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2849  aquaporin Z  37.36 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  hitchhiker  0.00425296 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  36.96 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  38.71 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  36.96 
 
 
231 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>