203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2326 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  100 
 
 		 261 aa  500  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  85 
 
 		 260 aa  411  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  61.74 
 
 		 453 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  61.54 
 
 		 247 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  56.9 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  59.55 
 
 		 408 aa  221  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  56.36 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  52.56 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  52.09 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  50.23 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  51.07 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  51.16 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  47.39 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  51.22 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  46.29 
 
 		 232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  45.83 
 
 		 232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  45.97 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  49.5 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  47.32 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  48.28 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  48.51 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  47.76 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  48.5 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  46.01 
 
 		 294 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  48.45 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  40.69 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  41.67 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  33.18 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  28.82 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  28.24 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1799  major intrinsic protein  32.64 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  33.49 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  32.68 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  31.37 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  31.14 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  30.41 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  31.82 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  31.82 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  30.65 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  28.86 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  29.94 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  30.1 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  27.94 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  29.25 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  32.66 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  25.58 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  30.45 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  29.3 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  32.32 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  31.74 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  31.74 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  29.56 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  31.74 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  28.46 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  32.75 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  31.74 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  31.74 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  30.19 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  31.74 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  31.74 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  31.74 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  31.74 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  31.74 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  30.89 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  32.14 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0516  major intrinsic protein  32.97 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  30.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  30.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  30.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  33.07 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  30.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  30.59 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  30.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  30.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  30.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  30.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  30.87 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  31.16 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  32.66 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  31.16 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  30.19 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  32.41 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  30.12 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  32.41 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  29.56 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  30.87 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  25.15 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  31.3 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  26.94 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  29.27 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  26.57 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  29.41 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  31.36 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  32.65 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  32.69 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  33.57 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  27.63 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  29.45 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  30.65 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>