124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3398 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  100 
 
 		 271 aa  530  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  65.92 
 
 		 294 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  56.16 
 
 		 223 aa  225  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  58.26 
 
 		 232 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  60.09 
 
 		 246 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  55.19 
 
 		 219 aa  211  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  53.12 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  56.34 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  53.49 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  60.09 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  50.44 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  54.46 
 
 		 233 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  58.08 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  52.49 
 
 		 233 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  56.12 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  48.64 
 
 		 232 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  52.24 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  50 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  51.9 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 		 408 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.48 
 
 		 453 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  49.51 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  49.25 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  49.52 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  46.26 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  45.85 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  48.28 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  39.09 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  31.55 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  37.04 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  31.55 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  28.74 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  36.46 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  31.67 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  32.05 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  38.53 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  39.18 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  31.66 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  36.84 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  34.62 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2575  major intrinsic protein  30.27 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  36.84 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  37.76 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  38.14 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  35.79 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  35.79 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  35.79 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  28.64 
 
 		 331 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  35.79 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  35.79 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  35.79 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  34.59 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  35.79 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  35.79 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  35.87 
 
 		 233 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0741  major intrinsic protein  36.84 
 
 		 357 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0791628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  37.76 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  40.43 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  37.11 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  35.19 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  35.24 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  38.68 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  38.68 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  35.19 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  35.19 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  37.5 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  36.17 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  32.5 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3008  major intrinsic protein  34.85 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0516  major intrinsic protein  40.66 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  36.73 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2078  aquaporin Z  39.53 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181948  hitchhiker  0.00125413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  36.73 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  39.36 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  37.84 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  37.23 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  34.74 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1147  major intrinsic protein  31.64 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  33.68 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  36.63 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  41.41 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  37.23 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  34.26 
 
 		 215 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  32.43 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  38 
 
 		 246 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  37.89 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  37.23 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  37.63 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  30 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  33.67 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28080  permease, glycerol uptake facilitator  42.47 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  37.11 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  31.58 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  38.46 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0028  aquaporin Z  41.03 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0322686  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  32.65 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  42.11 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  34.41 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  34.34 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  29.73 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>