127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2242 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  100 
 
 		 222 aa  431  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  73.49 
 
 		 219 aa  293  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  62.87 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  62.87 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  58.11 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  57.87 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  59.05 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  55.88 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  58.8 
 
 		 235 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  55.94 
 
 		 232 aa  217  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  59.52 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  59.41 
 
 		 235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  56.28 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  59.52 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  54.37 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  56.31 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  55.9 
 
 		 248 aa  187  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  48.84 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  52.5 
 
 		 294 aa  175  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  50.95 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  47.69 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  49.52 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.09 
 
 		 408 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.5 
 
 		 453 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  47.29 
 
 		 246 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  45.05 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  48.28 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  34.43 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  35.71 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5962  hypothetical protein  63.41 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  28.02 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  38.89 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  33.15 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  31.31 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  37.96 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  30.26 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  30.06 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  29.02 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  39.58 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  30.81 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  30.81 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  32.76 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  39.18 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  29.29 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  28.28 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  37.5 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  34.58 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  29.49 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  32.99 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  33.68 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  27.92 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  36.36 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  36.36 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  30.3 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  36.36 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  32.62 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  30.38 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  35.42 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  32.69 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  32.69 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  28.45 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  36.63 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  34.75 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  27.03 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  30.87 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  35 
 
 		 315 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  32.68 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  32.68 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  38.78 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  38.14 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  31.73 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  31.73 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  27.32 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  32.68 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  32.68 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  32.68 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  32.68 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  32.68 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  36.63 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  31.73 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  30.93 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  32.68 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  31.21 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  30.72 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  32.95 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  30.72 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  27.92 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  32.21 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  38.78 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  32.95 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  31.37 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  30.72 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  35.71 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  27.83 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  31 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  30.77 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0516  major intrinsic protein  39.19 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  31 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  31 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>