17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5962 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5962  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  76.09 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  73.91 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  75.56 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  73.33 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  50 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  60 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  60 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  47.06 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  49.12 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  49.06 
 
 		 235 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  61.76 
 
 		 222 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  50 
 
 		 232 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  48.78 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  42 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  46.34 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  38.6 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>