138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0565 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  100 
 
 		 260 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  85 
 
 		 261 aa  387  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  60 
 
 		 453 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  61.54 
 
 		 247 aa  244  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  57.85 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.97 
 
 		 408 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  56.56 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  52.56 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  52.09 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  49.77 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  51.39 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  51.16 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  50.47 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  44.69 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  49.51 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  44.54 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  45.93 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  45.45 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  47.8 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  49.25 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  48.22 
 
 		 235 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  49.75 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  44.39 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  50.52 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  46 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  42.79 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  42.31 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  34.84 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  30.22 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  28.9 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  32.08 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  32.08 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  31.6 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  32.08 
 
 		 281 aa  52  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  30.8 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  30.36 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  29.68 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  28.72 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  27.22 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  30.49 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  31.01 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  31.72 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  30.08 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  27.83 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  27.67 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  31.72 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  31.31 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  29.94 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  31.37 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  31.37 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1799  major intrinsic protein  31.25 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  31.37 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  31.37 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  31.37 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  31.37 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  31.37 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4409  glycerol uptake facilitator protein  30.77 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0436905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  31.37 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  29.15 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  36.52 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  24.58 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  28.66 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  30.04 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  30.43 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  28.66 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  28.03 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0683  glycerol uptake facilitator protein  30.56 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.962847  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  29.94 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0102  glycerol uptake facilitator protein  31.53 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0101  glycerol uptake facilitator protein  31.53 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4112  MIP family channel protein  31.53 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  29.27 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  31.73 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  30.33 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  32.68 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  29.56 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  30 
 
 		 283 aa  45.4  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03812  glycerol facilitator  30.36 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4058  MIP family channel protein  30.36 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  29.03 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  29.94 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  28.18 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  36.08 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  27.1 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  30.72 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4158  glycerol uptake facilitator protein  30.4 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4461  glycerol uptake facilitator protein  30.36 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.625465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  28.03 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03761  hypothetical protein  30.36 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4091  MIP family channel protein  30.36 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4367  glycerol uptake facilitator protein  30.36 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  29.94 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  38 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5382  glycerol uptake facilitator protein  30.36 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  33.15 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  29.59 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  32.38 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  29.58 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  27.35 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4303  glycerol uptake facilitator protein  30.04 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>