217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2245 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  100 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  70.31 
 
 		 232 aa  330  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  67.97 
 
 		 232 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  67.7 
 
 		 232 aa  304  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  70.79 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  61.01 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  60.65 
 
 		 233 aa  244  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  60.19 
 
 		 233 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  56.34 
 
 		 219 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  53.49 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  56.7 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  53.66 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  53.11 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  52.15 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  51.67 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  52.71 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  50.22 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  50.44 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.67 
 
 		 453 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  48.62 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.79 
 
 		 408 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  49.5 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  49.49 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  45.79 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  47.8 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  46.26 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  47.32 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  34.55 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  36.79 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  36.79 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  36.89 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  35.64 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  35.64 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  35.64 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  35.64 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  35.64 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  35.64 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  35.64 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  35.64 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  33.98 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  35.11 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  35.05 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  33.65 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  35.48 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  34.65 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  35.05 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  35.05 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  32.69 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  36.56 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  33.65 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  31.09 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  34.31 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  33.66 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  33.65 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  31.31 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  35.42 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  32.65 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  32.04 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  35.58 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  36.27 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  33.03 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  37.25 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  31.68 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  30.77 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  31.82 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  34.95 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  32.04 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  34.69 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  38 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  28.78 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  28.78 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  33.14 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  38.95 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  29.29 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  30.69 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  29.29 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  29.27 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  31.63 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  29.72 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  28.79 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  31.63 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  28.7 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  28.43 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  29.29 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  29.91 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  31.43 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  29.29 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  29.8 
 
 		 273 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  31.93 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2523  major intrinsic protein  30.22 
 
 		 279 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218151  normal  0.0321632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  30.48 
 
 		 273 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  31.07 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  31.07 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  33.06 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  31.29 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  33.33 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3008  major intrinsic protein  37.39 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  31.25 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  29.05 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>