62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2215 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  100 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  65.8 
 
 		 235 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  65.37 
 
 		 235 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  64.04 
 
 		 234 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  65.26 
 
 		 234 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  64.19 
 
 		 232 aa  255  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  55.5 
 
 		 219 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.61 
 
 		 453 aa  188  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  51.13 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  50.23 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.33 
 
 		 408 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  48.44 
 
 		 232 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  55.84 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  49.77 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  47.62 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  51.22 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  47.93 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  48.61 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  44.21 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  47.47 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  45.85 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  46.22 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  47 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  49 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  46.98 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  42.36 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  43.23 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  31.88 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5962  hypothetical protein  60 
 
 		 142 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  34.75 
 
 		 315 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  30.83 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  31.43 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  32.76 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  32.76 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  30.6 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  27.76 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  30.11 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  30.54 
 
 		 229 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  29.55 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  31.11 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  29.82 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  36.52 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  31.65 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  28.84 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  29.48 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  30.06 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  29.48 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  32.03 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  30.52 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  29.73 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  30.77 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  31.76 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  29.31 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  34.93 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  29.31 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  28.9 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  32.09 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  40.38 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  33.33 
 
 		 215 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  29.24 
 
 		 236 aa  42  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  30.06 
 
 		 247 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  30.92 
 
 		 239 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>