205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4430 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  100 
 
 
232 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  70.31 
 
 
232 aa  330  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  69.83 
 
 
232 aa  321  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  70.59 
 
 
232 aa  311  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  75 
 
 
235 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  64.81 
 
 
233 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  63.89 
 
 
233 aa  264  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  58.93 
 
 
223 aa  249  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  54.17 
 
 
219 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  50.44 
 
 
271 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  56.12 
 
 
222 aa  201  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  50.23 
 
 
232 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  49.56 
 
 
234 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  49.79 
 
 
247 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  53.11 
 
 
235 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  52.63 
 
 
235 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  50.44 
 
 
234 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  50.68 
 
 
245 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  52.8 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.32 
 
 
453 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  49.07 
 
 
233 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  44.54 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.62 
 
 
408 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  44.89 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  47.72 
 
 
248 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  45.5 
 
 
246 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  46.29 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  35.21 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  30.22 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  30.22 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  36.94 
 
 
263 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  39.78 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  30.69 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  36.17 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  34.95 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  32.37 
 
 
273 aa  52  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  36.19 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  33.98 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  29.11 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  29.96 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  35.42 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  34.38 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  37.36 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  35.29 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0741  major intrinsic protein  37.89 
 
 
357 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0791628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  35.29 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  35.29 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  34.62 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1799  major intrinsic protein  38.78 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2575  major intrinsic protein  37.62 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  36.36 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  35.48 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  31.29 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  33.33 
 
 
238 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5962  hypothetical protein  49.12 
 
 
142 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1571  MIP family channel protein  34.78 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.20348  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  27.14 
 
 
315 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  34.31 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  36.27 
 
 
247 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  33.98 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2523  major intrinsic protein  29.94 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218151  normal  0.0321632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  34.31 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1006  hypothetical protein  30.41 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188387  normal  0.916441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  35.48 
 
 
241 aa  48.5  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  34.31 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  34.31 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  36.46 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  30 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  27.35 
 
 
231 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  35.48 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  35.48 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  29.57 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  32.88 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  33.56 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  32.88 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  36.36 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  32.73 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  33.68 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  32.69 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  35.48 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  32.69 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  35.48 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  33.8 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  35.48 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  34.41 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  35.48 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  35.48 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  29.9 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  35.48 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  28.49 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  33.33 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  33.33 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  27.27 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  33.93 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  32.71 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  34.74 
 
 
250 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  33.33 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  33.93 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  33.33 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  35.42 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>