53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0223 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  100 
 
 
233 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  57.32 
 
 
453 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  58.82 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  56.56 
 
 
260 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  57.73 
 
 
247 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  57.84 
 
 
261 aa  202  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  54.5 
 
 
408 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  55.09 
 
 
233 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  55.14 
 
 
233 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  52.49 
 
 
271 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  55.4 
 
 
219 aa  191  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  48.03 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  53.96 
 
 
232 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  54.64 
 
 
235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  49.5 
 
 
232 aa  168  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  49.07 
 
 
232 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  51.78 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  48.86 
 
 
294 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  48.76 
 
 
223 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  45.45 
 
 
232 aa  158  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  44.5 
 
 
234 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  45.29 
 
 
235 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  45.87 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  44.5 
 
 
234 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  48.22 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  45.05 
 
 
246 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  44.55 
 
 
246 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  33.63 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  39.36 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  30.6 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  32.34 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  40.43 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  31.68 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  32.08 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  37.63 
 
 
232 aa  45.1  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  33.03 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  35.92 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  33.33 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  34.82 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  38.71 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  29.58 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  30.95 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  30.82 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  30.23 
 
 
247 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  35.05 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  29.34 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  35.11 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  35.05 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  35.05 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  28.3 
 
 
235 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  36.46 
 
 
234 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  34.02 
 
 
231 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  34.74 
 
 
232 aa  41.6  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>