166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8608 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  100 
 
 		 245 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  79.44 
 
 		 247 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  67.54 
 
 		 453 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  60.66 
 
 		 408 aa  255  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  57.85 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  56.9 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  58.82 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  52.75 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  48.75 
 
 		 234 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  50.68 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  48.54 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  47.76 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  53.59 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  46.67 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  48.62 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  50.23 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  51.58 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  50.71 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  52.15 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  50.7 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  49.77 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  49.52 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  48.73 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  42.98 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  47.78 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  41.8 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  42.86 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  35.81 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  43.43 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  42.72 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  43.69 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  33.91 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  42.72 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  42.42 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  39.13 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  43.43 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  41.75 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  40.37 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  41.75 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  41.75 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  41.75 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  41.75 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  39.42 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  35.4 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  38.83 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  38.38 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  39.42 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  39.22 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  37.86 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  39.81 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  39.45 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  37.8 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  36.28 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  40.4 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  37.62 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  31.46 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  37.27 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  42.42 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  33.9 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  33.9 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  39.39 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  39.25 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  39.42 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  39.25 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  39.25 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  41.41 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  39.39 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  39.39 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  33.9 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  39.39 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  39.39 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  39.39 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  39.39 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  39.39 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  37.37 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  33.33 
 
 		 283 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  38.46 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  39.6 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  38.38 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3802  MIP family channel protein  31.43 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17980  glycerol uptake facilitator protein  32.74 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  39.42 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  39.39 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  36.44 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  36.36 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  36.94 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  41.41 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  34.17 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  31.43 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  38.38 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  36.94 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  39.02 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  39.6 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  38.66 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0109  MIP family channel protein  32 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2078  aquaporin Z  46.05 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181948  hitchhiker  0.00125413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  39.05 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  32.99 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>