219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4200 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  100 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  70.59 
 
 		 232 aa  311  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  76.5 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  67.7 
 
 		 232 aa  304  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  64.47 
 
 		 232 aa  287  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  70.18 
 
 		 223 aa  275  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  65.12 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  63.72 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  61.93 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  53.12 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  61.26 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  55.87 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  55.5 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  53.11 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  53.17 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  52.05 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  53.49 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  53.77 
 
 		 294 aa  185  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  47.76 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  53.96 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  48.44 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.71 
 
 		 453 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 		 408 aa  161  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  46.01 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  46.95 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  44.39 
 
 		 260 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  48.51 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  36.87 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  34.04 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  34.04 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  39.36 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  32.39 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  35.42 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  39.58 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  35.98 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  36.23 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  34.04 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  37.25 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  38.24 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  37.5 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  36.08 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  36.08 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  34.62 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  34.62 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  39.56 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  37.16 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  37.63 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  38.46 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  31.85 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  36.08 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  34.38 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  36.45 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  36.45 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  36.45 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  31.47 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  34.38 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  36.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  36.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  36.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  36.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  31.11 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  38.46 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  36.46 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  36.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  36.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  36.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  39.56 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  36.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  33.98 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  33.98 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  36.26 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  35.42 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  37.5 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  28.45 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  34.04 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  35.16 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  38.46 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  26.74 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  32.43 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  31.08 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  34.38 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  35.05 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  35.05 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  36.19 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  37.78 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  34.31 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  33.04 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  34.31 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  36.67 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  33.04 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  32.99 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  35.16 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  33.33 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  38 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  35 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  33.33 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  30.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  38.71 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  35.16 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  37.78 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>