163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3541 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  100 
 
 		 294 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  66.29 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  60.75 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  57.94 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  52.89 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  53.52 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  53.46 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  53.99 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  52.27 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  53.05 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  53.77 
 
 		 232 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  50.44 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  56.06 
 
 		 235 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  48.86 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  54.89 
 
 		 222 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  45.89 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  48.34 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  45.18 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.22 
 
 		 453 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  43.1 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  47.17 
 
 		 234 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  46.85 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  47.17 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  46.58 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  45.59 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.59 
 
 		 408 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  45.62 
 
 		 261 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  34.88 
 
 		 231 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  33.11 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  33.11 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  35.96 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  30.94 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  37.5 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  35.79 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0206  MIP family channel protein  33.64 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  39.42 
 
 		 216 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  40.86 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  28.51 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  37.04 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  36.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  36.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  36.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  36.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  38.71 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  36.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  36.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  36.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  36.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  38.71 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  32.63 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  37.89 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  37.89 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  36.08 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  33.98 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  31.18 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  30.04 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  38.18 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  35.48 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  26.38 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3485  major intrinsic protein  32.52 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0741  major intrinsic protein  35.4 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0791628  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  27.75 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  35.79 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3008  major intrinsic protein  39.17 
 
 		 398 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  32.26 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  32.71 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  32.98 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  35.19 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  29.65 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  32.81 
 
 		 220 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1147  major intrinsic protein  30.49 
 
 		 300 aa  48.9  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  33 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  37.63 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2529  MIP family channel protein  28.09 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00000981232  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2575  major intrinsic protein  29.41 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  34.62 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  37.23 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  30.97 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1799  major intrinsic protein  37.11 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  33.01 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  33.01 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  33.01 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1589  major intrinsic protein  30.97 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026297 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  35.48 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  28.99 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  36.84 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  28.69 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  31.86 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  33.9 
 
 		 449 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  34.74 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  32.74 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  36.04 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  31.36 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  34.41 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  28.29 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  30.97 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  30.97 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  29.34 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  32.29 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>