273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3485 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3485  major intrinsic protein  100 
 
 
296 aa  594  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1147  major intrinsic protein  49.82 
 
 
300 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  34.52 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1571  MIP family channel protein  32.13 
 
 
269 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.20348  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2523  major intrinsic protein  31.14 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218151  normal  0.0321632 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  32.14 
 
 
227 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  34.55 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  27.43 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  33.54 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  34.76 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  34.76 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  30.93 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  30.61 
 
 
234 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  30.84 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  27.65 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  33.87 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  32.8 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  30.08 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  32.8 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  32.98 
 
 
226 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  30.34 
 
 
216 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  32.42 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  27.6 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  33.51 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  27.16 
 
 
238 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  28.88 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  30.57 
 
 
232 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2575  major intrinsic protein  30.52 
 
 
318 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  29.22 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  29.49 
 
 
232 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  30.7 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  29.84 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  29.55 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  29.55 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  29.55 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  29.55 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  29.55 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  29.55 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  29.55 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  29.55 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  29.55 
 
 
273 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  29.55 
 
 
273 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4329  MIP family channel protein  32.26 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02450  water channel, putative  28.7 
 
 
371 aa  59.7  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.889441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  30.13 
 
 
232 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  25.93 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  25.93 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  25.93 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  25.93 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  25.93 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  25.93 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  25.93 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  29.63 
 
 
228 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  30.73 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  28.49 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  29.47 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  29.26 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  33.14 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  31.55 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  28.49 
 
 
221 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  29.19 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  29.19 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  31.86 
 
 
234 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0741  major intrinsic protein  28.57 
 
 
357 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0791628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  28.49 
 
 
221 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  27.65 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  28.49 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  27.62 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  27.93 
 
 
221 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  27.93 
 
 
221 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  28.49 
 
 
221 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  27.78 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  28.49 
 
 
221 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  28.85 
 
 
249 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  30.17 
 
 
245 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10902  MIP aquaporin (Eurofung)  30.85 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  27.73 
 
 
231 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  32.76 
 
 
250 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0154  MIP family channel protein  32.14 
 
 
218 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0333  major intrinsic protein  32.14 
 
 
218 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.881895  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  32.04 
 
 
251 aa  55.8  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  30.58 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15980  MIP family channel protein  29.44 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  27.98 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  30 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  30.6 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  28.57 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  27.93 
 
 
221 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  27.05 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  29.06 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  28.92 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  27.93 
 
 
221 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  29.28 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  26.94 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  27.23 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  28.73 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  30.2 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  29.27 
 
 
231 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  26.67 
 
 
231 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0175  MIP family channel protein  30.2 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>