237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2523 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2523  major intrinsic protein  100 
 
 
279 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218151  normal  0.0321632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1571  MIP family channel protein  46.52 
 
 
269 aa  214  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.20348  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  33.17 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3485  major intrinsic protein  31.14 
 
 
296 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  31.89 
 
 
240 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  31.89 
 
 
240 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  35.83 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  30.77 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  28.88 
 
 
230 aa  82  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  31.61 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  28.14 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  30.89 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  30.11 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  27.55 
 
 
232 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  29.15 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  28.14 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  28.14 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  30.98 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  29.15 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  30.32 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  31.43 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  33.9 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  29.47 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  27.78 
 
 
231 aa  72  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  29.47 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  28.14 
 
 
229 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  27.81 
 
 
237 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  28.64 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  30.73 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  30.12 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  29.52 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  30.12 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  29.52 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  29.52 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  29.47 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  29.52 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  28.35 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  26.5 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  26.49 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  29.52 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  28.92 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  29.52 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  25.37 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  27.23 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  26.37 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  32.74 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1147  major intrinsic protein  31.22 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  27.75 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  28.43 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  30.37 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  29.76 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  30.15 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  31.96 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  26.26 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  30.54 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  25.64 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  30.65 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  30.94 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  31.25 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  28.02 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  27.23 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  27.42 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  28.57 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  30.69 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0154  MIP family channel protein  31 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  27.32 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0333  major intrinsic protein  31 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.881895  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  30.16 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  32.93 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  29.65 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  28.1 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  28.43 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  26.18 
 
 
246 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  27.09 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  26.56 
 
 
232 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  25.67 
 
 
230 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  28.93 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  25.21 
 
 
238 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1929  MIP family channel protein  32.26 
 
 
247 aa  62.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  28.19 
 
 
220 aa  62.4  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2529  MIP family channel protein  27.81 
 
 
339 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00000981232  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  22.77 
 
 
231 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0160  MIP family channel protein  30.46 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  25.27 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  27.32 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4068  Aquaporin Z  26.86 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  24.88 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  30.46 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  24.43 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2575  major intrinsic protein  31.06 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  27.78 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  26.92 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  24.73 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  26.5 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  27.78 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  27.78 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  26.74 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  27.78 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  27.78 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  27.78 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>