117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05492 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  100 
 
 		 232 aa  448  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  79.64 
 
 		 234 aa  345  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  81.4 
 
 		 235 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  81.45 
 
 		 234 aa  338  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  80 
 
 		 235 aa  337  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  67.18 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  56.94 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  54.55 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  61.34 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  53.11 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  51.8 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  50.23 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  52.58 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  55.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  51.67 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  53 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  54.9 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  52.75 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.05 
 
 		 453 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.45 
 
 		 408 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  51.63 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  48.64 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  50.73 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  45.45 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  47.44 
 
 		 294 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  45 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  45.66 
 
 		 246 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  34.93 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5962  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  35.51 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  35.33 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  35.33 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  35.33 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  34.57 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  36.36 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  36.36 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  34.73 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  34.73 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  38 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  37.89 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  34.16 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  33.95 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  35.51 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  35.15 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  32.1 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  34.55 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  34.55 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  34.55 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  34.55 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  34.55 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  34.55 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  34.55 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  40.38 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20755  predicted protein  31.22 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  28.97 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  30.05 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  34.09 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  33.98 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  29.1 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  36.36 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  29.13 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  31.74 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  28.16 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  34.31 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  33.33 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02822  MIP aquaporin (Eurofung)  34.86 
 
 		 449 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  32.2 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  34.95 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  35 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  30.54 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  35 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0897  MIP family channel protein  40 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  37.62 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  30.54 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  28.02 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4068  Aquaporin Z  37.5 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  30.13 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  33.98 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  28.63 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  30.77 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  30.77 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  30.54 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  28.74 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  28.21 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  40.78 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  37.25 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  30 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  28.07 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  29.49 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  32.12 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  29.12 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  29.34 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  32.92 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  32.52 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2214  propanediol diffusion facilitator  32.8 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.839168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2260  propanediol diffusion facilitator  32.8 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2207  propanediol diffusion facilitator  32.8 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.863127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2160  propanediol diffusion facilitator  32.8 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2373  propanediol diffusion facilitator  32.8 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0974119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  28.07 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>