178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2336 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  100 
 
 
219 aa  421  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  76.53 
 
 
222 aa  264  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  61.21 
 
 
233 aa  254  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  60.65 
 
 
233 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  63.08 
 
 
223 aa  249  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  61.93 
 
 
232 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  57.28 
 
 
232 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  54.17 
 
 
232 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  58.08 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  56.34 
 
 
232 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  55.19 
 
 
271 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  56.94 
 
 
232 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  59.31 
 
 
235 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  54.93 
 
 
234 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  56.81 
 
 
234 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  58.62 
 
 
235 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  55.4 
 
 
233 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  55.5 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  53.46 
 
 
294 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  54.07 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  50.47 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.68 
 
 
453 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  52.15 
 
 
245 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.72 
 
 
408 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  51.87 
 
 
261 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  46.79 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  46.79 
 
 
246 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  36.81 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  30.74 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  31 
 
 
245 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  30.57 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  33.18 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  42.39 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  30.05 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  31.71 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  31.03 
 
 
240 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  31.03 
 
 
240 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  41.12 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  30.35 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  29.08 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  37.89 
 
 
234 aa  58.5  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  30.08 
 
 
231 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  29.69 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  30.57 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  29.38 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  29.38 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  28.06 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  31.77 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  30.57 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  30.1 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  30.13 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  38.78 
 
 
239 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  41.41 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  38.37 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  31.09 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  37.5 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  30.5 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  34.69 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  28.07 
 
 
232 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  36.84 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  31.84 
 
 
256 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  27.55 
 
 
246 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  32.69 
 
 
247 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  32.69 
 
 
247 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  45.74 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  30.57 
 
 
231 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  32.69 
 
 
247 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  30.05 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0741  major intrinsic protein  42.55 
 
 
357 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0791628  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5962  hypothetical protein  60 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  29.13 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  28.21 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  36.73 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  31.05 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  36.73 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  36.73 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  33.65 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  33.33 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  29.74 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  29.74 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  29.23 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  29.74 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  29.74 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  29.74 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  29.74 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  29.74 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  36.46 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  35.48 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  32.32 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  30.05 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  30.05 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  30.21 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>