232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3256 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  100 
 
 		 235 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  93.59 
 
 		 235 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  86.64 
 
 		 234 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  87.5 
 
 		 234 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  80 
 
 		 232 aa  337  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  69.39 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  59.31 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  55.87 
 
 		 232 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  55.61 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  54.46 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  52.7 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  59.79 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  56.63 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  52.15 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  52.63 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  52.09 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.65 
 
 		 408 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  51.8 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  53.05 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.27 
 
 		 453 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  51.58 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  50 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  51.27 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  45.87 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  45.18 
 
 		 294 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  47.2 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  45.58 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5962  hypothetical protein  75.56 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  34.94 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  37.67 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  36.14 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  36.14 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  35.19 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  35.8 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  35.8 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  34.97 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  33.73 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  34.55 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  35.19 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  33.74 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  33.74 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  33.74 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  33.74 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  33.74 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  33.74 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  33.51 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  33.74 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  34.76 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  32.02 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  33.71 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  31.84 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  36.3 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  31.93 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  28.03 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  29.57 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  29.57 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  28.41 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  34.81 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  33.73 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  33.83 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  28.57 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  31.29 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  28.15 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  43 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  31.37 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  42 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  38.61 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  35.19 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  35.19 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  26.69 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  30.77 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  35.19 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  26.69 
 
 		 279 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  30.11 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  41.18 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  33.12 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  31.56 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  30.71 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  32.92 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  29.73 
 
 		 289 aa  52  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  41.18 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  35.09 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  34.58 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  34.15 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  30.82 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  33.33 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  38.54 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  41.18 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  36.65 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  41.67 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  41 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  33.95 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  33.95 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  35.96 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  41.49 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6965  major intrinsic protein  38.32 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113023  normal  0.0476417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  34.81 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  29.05 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  33.12 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  33.12 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>