118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5423 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  100 
 
 		 247 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  79.44 
 
 		 245 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  67.09 
 
 		 453 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  61.35 
 
 		 408 aa  265  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  61.54 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  61.54 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  57.73 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  49.79 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  49.13 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  50.22 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  54.63 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  53 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  53.49 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  48.74 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  50.45 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  51.8 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  54.07 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  51.8 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  51.42 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  51.89 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  51.9 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  51.9 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  47.45 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  46.85 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  50 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  44.53 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  42.51 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  36.09 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  32.26 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  39.42 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  37.17 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  39.39 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  39.39 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  37.39 
 
 		 263 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  32.94 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  36.54 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  37.25 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  32 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  40.78 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  44.05 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  44.05 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  35.61 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  35.61 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  35.61 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00880  aquaporin Z  36.36 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2767  MIP family channel protein  36.36 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  37.86 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  37.37 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00886  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0948  aquaporin Z  36.36 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  38.83 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2721  aquaporin Z  36.36 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2285  aquaporin Z  36.36 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.134146  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2456  aquaporin Z  36.36 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1036  aquaporin Z  36.36 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  34.55 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  37.86 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  34.95 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  38.05 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  36.89 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  33.33 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0500  MIP family channel protein  34.88 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44871  predicted protein  28.65 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  37.61 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  36.89 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  35.83 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0632  major intrinsic protein  36.63 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.219434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  37.14 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  30.06 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  36.89 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1117  MIP family channel protein  30.06 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  27.52 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  36.89 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  32.32 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  38.53 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  35.35 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  34.95 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4336  MIP family channel protein  30.06 
 
 		 283 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  32.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  37.14 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  39.39 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  31.58 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0979  aquaporin Z  35.35 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  32.67 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  31.58 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  38.38 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  35.64 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  33.93 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  35.64 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  33.64 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  34.95 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  33.05 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  35.35 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2584  MIP family channel protein  40.58 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137548  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  39.74 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  29.94 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  44.93 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  32.43 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4797  MIP family channel protein  30.86 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000240891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4531  Aquaporin  34.21 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174053  normal  0.147352 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>