More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1213 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  80.66 
 
 
243 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  54.36 
 
 
250 aa  267  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  51.43 
 
 
289 aa  245  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  52.54 
 
 
234 aa  241  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  52.54 
 
 
234 aa  241  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  46.15 
 
 
282 aa  224  7e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  49.44 
 
 
287 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2341  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  42.56 
 
 
289 aa  219  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.395885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  47.86 
 
 
275 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  46.03 
 
 
235 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  46.03 
 
 
250 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  45.61 
 
 
235 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  47.86 
 
 
242 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  45.38 
 
 
236 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  44.93 
 
 
232 aa  199  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  45.97 
 
 
255 aa  196  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  45.96 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  49.32 
 
 
273 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  47.96 
 
 
273 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  45.02 
 
 
272 aa  194  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  48.87 
 
 
273 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  48.87 
 
 
273 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  40.56 
 
 
287 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  48.42 
 
 
273 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  48.42 
 
 
273 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  48.42 
 
 
278 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  48.42 
 
 
278 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  47.96 
 
 
273 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  44.68 
 
 
242 aa  191  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  47.96 
 
 
278 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  47.96 
 
 
273 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  44.83 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  44.83 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  44.59 
 
 
237 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  43.59 
 
 
274 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  44.16 
 
 
237 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  45.92 
 
 
241 aa  184  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  42.92 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  44.1 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  42.06 
 
 
237 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  45.16 
 
 
238 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  41.45 
 
 
238 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  41.45 
 
 
238 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  41.45 
 
 
238 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  41.45 
 
 
238 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  41.45 
 
 
238 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  41.45 
 
 
238 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  41.45 
 
 
238 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  46.08 
 
 
238 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  46.08 
 
 
238 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  45.62 
 
 
238 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  45.16 
 
 
238 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  45.16 
 
 
238 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  45.16 
 
 
238 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  43.89 
 
 
242 aa  178  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  39.33 
 
 
243 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  46.58 
 
 
233 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  44.29 
 
 
244 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  43.39 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  45.06 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  44.24 
 
 
242 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  41.53 
 
 
239 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  42.17 
 
 
240 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  41.13 
 
 
238 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  43.11 
 
 
244 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  40.66 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  39.83 
 
 
239 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  40 
 
 
235 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  38.12 
 
 
247 aa  158  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  39.66 
 
 
249 aa  158  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  40 
 
 
246 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  42.6 
 
 
249 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  40.99 
 
 
241 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  39.83 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  39.29 
 
 
241 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  37.34 
 
 
246 aa  148  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  38.65 
 
 
252 aa  148  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  39.58 
 
 
259 aa  144  9e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  39.41 
 
 
245 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  40.59 
 
 
244 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  39.66 
 
 
245 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  36.47 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  37.23 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  36.73 
 
 
246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  34.31 
 
 
252 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  33.74 
 
 
268 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  36.82 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  33.88 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  36.15 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1392  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  34.87 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000178707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  34.17 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  32.2 
 
 
251 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  34.22 
 
 
315 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  33.58 
 
 
340 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  33.2 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  33.61 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  31.87 
 
 
267 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  36.68 
 
 
338 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1388  MIP family channel protein  31.52 
 
 
275 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>