More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1988 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 
321 aa  659    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  41.99 
 
 
192 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
190 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  35.03 
 
 
190 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
190 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  31.61 
 
 
194 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  31.66 
 
 
203 aa  99.4  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0308  NADPH-dependent FMN reductase  37.33 
 
 
204 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.471384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  35.16 
 
 
202 aa  93.2  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  31.61 
 
 
179 aa  92.4  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  30.46 
 
 
208 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  37.16 
 
 
195 aa  90.5  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  32.1 
 
 
209 aa  89  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  37.39 
 
 
186 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  38.26 
 
 
186 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  35.67 
 
 
173 aa  86.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3414  NADPH-dependent FMN reductase  31.84 
 
 
186 aa  86.3  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2856  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
210 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  33.91 
 
 
183 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  28.33 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2184  iron-sulfur flavoprotein, putative  34.03 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0986799  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  35.59 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 
208 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0542  iron-sulfur flavoprotein, putative  28.8 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.423785  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  35.07 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  29.65 
 
 
204 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  39.25 
 
 
194 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 
193 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  39.05 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0166  NADPH-dependent FMN reductase  30.57 
 
 
196 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  32.28 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  32.33 
 
 
185 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  35.37 
 
 
207 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  26.59 
 
 
199 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1732  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 
231 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00073887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  36.92 
 
 
195 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 
133 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  34.65 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.8 
 
 
139 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 
179 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  36.43 
 
 
135 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.11 
 
 
137 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  27.5 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  30.83 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0785  iron-sulfur flavoprotein, putative  30 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0958732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  30.88 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.59 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  36.45 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  34.65 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  30.37 
 
 
193 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  28.18 
 
 
183 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  31.62 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.21 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  37.5 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.65 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  39.62 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0988  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.327411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  37.23 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  33.08 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
178 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  36.19 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.88 
 
 
136 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  35.88 
 
 
136 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  31.53 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  33.59 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 
150 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  30.54 
 
 
172 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 
144 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  36.43 
 
 
223 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  33.6 
 
 
125 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  29.92 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.75 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  32.08 
 
 
197 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.86 
 
 
453 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  33.03 
 
 
197 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  35.83 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  34.65 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  28.9 
 
 
184 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>