189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0507 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0507  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
154 aa  306  5.9999999999999995e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60 
 
 
151 aa  159  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.18 
 
 
141 aa  158  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1811  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.19 
 
 
140 aa  156  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178186  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3446  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.78 
 
 
150 aa  152  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3558  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.84 
 
 
127 aa  136  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.41 
 
 
143 aa  130  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  43.97 
 
 
294 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.7 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.62 
 
 
137 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.42 
 
 
135 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  43.31 
 
 
136 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  44.96 
 
 
136 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.38 
 
 
139 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.77 
 
 
138 aa  104  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.91 
 
 
141 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.31 
 
 
139 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.86 
 
 
141 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  39.86 
 
 
147 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.77 
 
 
150 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.73 
 
 
150 aa  101  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  44.88 
 
 
215 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.79 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.86 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  42.4 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
225 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.09 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
217 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
217 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
217 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  39.06 
 
 
223 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
225 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.94 
 
 
453 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.06 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  40.32 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  37.9 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  38.46 
 
 
498 aa  92  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 
132 aa  92  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.28 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 
222 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  40.48 
 
 
174 aa  84  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.78 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4721  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.46 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.43 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  36.03 
 
 
337 aa  82  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.6 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.21 
 
 
227 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.46 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  36.72 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.48 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  38.4 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.98 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  33.85 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  34.81 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  31.85 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.75 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  34.11 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  34.09 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  35.66 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  31.88 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  32.82 
 
 
336 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  33.58 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0790  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.56 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  31.11 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  26.09 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  29.92 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  29.29 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  32.09 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  30.37 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  35.43 
 
 
349 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2681  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.04 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00909873  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  29.58 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  29.71 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  34.29 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.32 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  34.33 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.04 
 
 
588 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  28.17 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  30.23 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  28.17 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  28.17 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2256  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.79 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.829785 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  28.17 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1477  protein tyrosine phosphatase  27.97 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.334169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  27.46 
 
 
134 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  28.99 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  27.46 
 
 
134 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  28.47 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  29.17 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>