More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3220 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
142 aa  283  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  63.36 
 
 
138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  62.88 
 
 
137 aa  163  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0790  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.75 
 
 
136 aa  160  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2681  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  64.75 
 
 
136 aa  158  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00909873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  55.07 
 
 
147 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.03 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.73 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  51.15 
 
 
148 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31160  protein-tyrosine-phosphatase  51.49 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11640  protein-tyrosine-phosphatase  53.73 
 
 
138 aa  126  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.181279 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  51.45 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2256  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.28 
 
 
128 aa  100  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.829785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.97 
 
 
215 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  42.31 
 
 
498 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.26 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.54 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  39.68 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  40.77 
 
 
136 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.69 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.92 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.04 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.73 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 
217 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 
217 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36.92 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 
217 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.42 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.84 
 
 
150 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
225 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.12 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  36.92 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  39.23 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.64 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  35.61 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3221  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.779486  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.84 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  30.6 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.92 
 
 
453 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
337 aa  78.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.66 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
225 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  39.68 
 
 
347 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26450  protein-tyrosine-phosphatase  44.78 
 
 
294 aa  77  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.288581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.94 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.62 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  35.51 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3745  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.15 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1221  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.3 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000129127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  30.37 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.08 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.82 
 
 
227 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  29.03 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2683  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.09 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0641412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.06 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.03 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  35.25 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  31.43 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  35.16 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1110  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_151  arsenate reductase-like protein  34.33 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.68 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.71 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  31.43 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  37.9 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2364  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  30.53 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.09 
 
 
287 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  34.06 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0588  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.85 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  36.03 
 
 
299 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  44.87 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.81 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  29.17 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 
337 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_002936  DET0143  arsenate reductase  32.59 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.596044  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21340  protein-tyrosine-phosphatase  35.59 
 
 
255 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  37.32 
 
 
349 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  31.11 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.33 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  35.97 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.62 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2433  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.33 
 
 
141 aa  60.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  42.19 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>