More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4792 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  90.32 
 
 		 155 aa  266  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  76.92 
 
 		 157 aa  249  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  76.92 
 
 		 157 aa  249  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  76.92 
 
 		 157 aa  248  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  80.14 
 
 		 142 aa  237  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  61.07 
 
 		 170 aa  190  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  62.67 
 
 		 153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  62.32 
 
 		 155 aa  187  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  60.56 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  57.82 
 
 		 155 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  55.24 
 
 		 152 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.14 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  55.07 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  56.76 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  55.07 
 
 		 155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  56.43 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  56.34 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.63 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  51.66 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  50.31 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  45.52 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  52.55 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  52.55 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  51.08 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  45.52 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  45.52 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  45.65 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  46.04 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  44.6 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  38.46 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.81 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.57 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  37.12 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  36.03 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.29 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.58 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.93 
 
 		 287 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  30.08 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  30.15 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.04 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.2 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  34.85 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  30.71 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.09 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  33.57 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.61 
 
 		 299 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 269 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  30.83 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.77 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.09 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  27.78 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.94 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  31.16 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  35.38 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  30.92 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  28.87 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  29.1 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.58 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  31.43 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  28.99 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  32.81 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  29.37 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  31.62 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  27.82 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.71 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.14 
 
 		 588 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  27.21 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  32.54 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.55 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  32.06 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  26.95 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  29.63 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  30.37 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.57 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  25.55 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.33 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>