More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2282 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 161 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  99.38 
 
 		 163 aa  333  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  92.99 
 
 		 159 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  77.78 
 
 		 152 aa  248  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  75.69 
 
 		 151 aa  242  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  76.76 
 
 		 151 aa  236  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  76.55 
 
 		 151 aa  236  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  50.99 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  49.01 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.7 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  45.33 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  48.61 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  48.59 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.52 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.86 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.86 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.72 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  47.14 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  47.92 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 		 150 aa  127  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  46.76 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  41.5 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  44.37 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  44.37 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  43.75 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.36 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  42.25 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  36.55 
 
 		 144 aa  88.2  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  38.73 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.78 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.59 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.81 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.03 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  30.34 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  30.5 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.66 
 
 		 299 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  30.61 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  29.85 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.85 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.78 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  28.37 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  27.97 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.61 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  30.5 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  34.35 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  30.53 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.99 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 131 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  31.65 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.86 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  29.25 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  29.5 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  29.79 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  30.37 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  28.77 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.65 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  28.87 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.2 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.92 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  32.65 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  30.66 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.56 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  27.94 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  27.97 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  31.47 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0759  protein tyrosine phosphatase  29.1 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  27.92 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  30.99 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  25.71 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  26.87 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  27.63 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  30.37 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  28.87 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  31.43 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.47 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  28.47 
 
 		 498 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  27.86 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.37 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  26.09 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  32.06 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.32 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1151  protein tyrosine phosphatase  29.1 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.734806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.47 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1659  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  29.29 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>