More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0899 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 156 aa  324  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  79.73 
 
 		 170 aa  258  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  75.66 
 
 		 155 aa  254  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  76.87 
 
 		 155 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  76.6 
 
 		 149 aa  229  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  74.66 
 
 		 155 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  72.73 
 
 		 152 aa  220  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  57.82 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  62.07 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.38 
 
 		 157 aa  184  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  61.38 
 
 		 157 aa  184  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.56 
 
 		 155 aa  183  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  61.15 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.31 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  61.31 
 
 		 150 aa  177  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  64.54 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  57.25 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.85 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  53.85 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  52.74 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  51.01 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  51.05 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  51.77 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  51.77 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  52.17 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  48.61 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  48.61 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  48.25 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  48.2 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  45.83 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  43.06 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  43.54 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  43.97 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  41.35 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  34 
 
 		 299 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  34.31 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  37.25 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.67 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  33.1 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.07 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.59 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.76 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  35.43 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.77 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.78 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.35 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  36.51 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  33.99 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  35.82 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.17 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  36.5 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  44.58 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  36.03 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.56 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  35.61 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  35.61 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 258 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  33.83 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  29.03 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.09 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  36.22 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  32.14 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  32.84 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.56 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.08 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  33.6 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  42.35 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  32.64 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  33.09 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  33.33 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  34.04 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.33 
 
 		 588 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.68 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 276 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.76 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  31.17 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  32.85 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  31.3 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  32.61 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>