210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0241 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 158 aa  321  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  92.41 
 
 		 158 aa  300  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  75.94 
 
 		 159 aa  220  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  68.31 
 
 		 167 aa  210  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  59.86 
 
 		 157 aa  177  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  59.18 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  58.45 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  57.35 
 
 		 166 aa  170  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  55.88 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  54 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  56.94 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.15 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  53.79 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  53.85 
 
 		 156 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  52.74 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  52.67 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.34 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  59.15 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.15 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  59.15 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.68 
 
 		 170 aa  153  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  56.52 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  47.59 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  56.34 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  43.36 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  41.84 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.43 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  35.16 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  34.65 
 
 		 299 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  31.71 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.83 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.09 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.99 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  32.84 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.66 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  31.78 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  31.45 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  31.34 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  30.83 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  28.79 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  30.23 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.85 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.01 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  29.32 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  31.06 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  26.52 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  30.65 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.79 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.27 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  29.03 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  28.03 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  29.55 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  26.9 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  29.1 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  27.78 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  32.64 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.27 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  28.26 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.07 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.06 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  26.53 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  28.36 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  26.72 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  26.52 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  27.07 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  32.09 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  30.83 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  36.25 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  25.74 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  28.68 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  26.28 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  30.22 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  27.01 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  27.21 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  32.61 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.24 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  26.27 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 255 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  28.91 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.34 
 
 		 588 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  29.17 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  29.08 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 258 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  28.68 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  24.62 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  27.14 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 258 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>