More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0666 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 150 aa  311  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  71.43 
 
 		 151 aa  239  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  61.31 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  60.29 
 
 		 170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  58.82 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.83 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  55.88 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  59.56 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  60.45 
 
 		 155 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  55.97 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  58.74 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  58.52 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.74 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  57.04 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  58.04 
 
 		 157 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  54.48 
 
 		 155 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  58.57 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.43 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  50.68 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  51.11 
 
 		 166 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  56.12 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  50.36 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  49.25 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  53.44 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  51.88 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  53.44 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  41.67 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  43.88 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  45.93 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  35.61 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.78 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  36.3 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.06 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.51 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  38.28 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.48 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  29.8 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.34 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  34.11 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  32.61 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.27 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  30.5 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  30.15 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  32.79 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.14 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.36 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  29.93 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  32.82 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  33.81 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  29.37 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  34.04 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  30.53 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  29.85 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  27.48 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  27.34 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.58 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  30.3 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.15 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  30.08 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  29.79 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.61 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  29.73 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0488  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  28.99 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  27.41 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  32.04 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  31.43 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.34 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2232  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.88 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  28.36 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  32.84 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1685  protein tyrosine phosphatase  32.39 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  32.84 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  30.37 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  24.82 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  29.63 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  29.63 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>