More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0523 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 160 aa  320  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  46.98 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  48.25 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  46 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  45.21 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.76 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  45.93 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  43.97 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  43.17 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  43.17 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.96 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  39.16 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  42.36 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.7 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.29 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.57 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.29 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 		 142 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  34.51 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.84 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  33.09 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  29.55 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.03 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  30.53 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.94 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.85 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  29.32 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  33.07 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  30.08 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  31.3 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  31.06 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.32 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  34.07 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1656  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0413264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  28.89 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  28.24 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.84 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  32.82 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  28.12 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  31.34 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  30.88 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  29.29 
 
 		 588 aa  58.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  30.3 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.33 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  36.54 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.58 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.11 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  32.12 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  34.06 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  29.13 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 257 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  28.7 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  32.38 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  32.09 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.14 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  28.37 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  26.32 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  29.77 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  26.62 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  29.01 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.41 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.94 
 
 		 453 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.6 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0216  protein tyrosine phosphatase  27.66 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  30.77 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  27.14 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  30.66 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.25 
 
 		 287 aa  54.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.82 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  29.63 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  29.63 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  27.74 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>