More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2259 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  98.72 
 
 		 157 aa  322  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  87.23 
 
 		 142 aa  268  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  76.92 
 
 		 155 aa  249  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  80.42 
 
 		 155 aa  225  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  64.75 
 
 		 170 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  60.93 
 
 		 153 aa  186  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  61.38 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  62.59 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  58.62 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.74 
 
 		 151 aa  167  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  59.72 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  57.75 
 
 		 152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  58.27 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  58.74 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  58.27 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  59.15 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.75 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  47.18 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  48.98 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  50.71 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  51.45 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  51.45 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  45.75 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  47.14 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  44.68 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  44.68 
 
 		 149 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  48.57 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  44.68 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.36 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  34.07 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.72 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.86 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  32.17 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 299 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.1 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  34.35 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.29 
 
 		 299 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  34.75 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  30.83 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.57 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.62 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  27.94 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  32.19 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  34.38 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  28.37 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.88 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  36.84 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  28.26 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  26.39 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13220  protein-tyrosine-phosphatase  35.97 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.25 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  29.1 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  31.34 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.09 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  34.56 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 258 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 		 254 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  32.84 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  29.85 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  28.89 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.23 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1444  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.07 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3220  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  29.92 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3649  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.53 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  30.88 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  40.43 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.77 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.28 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  39.56 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.51 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  27.54 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  27.61 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  32.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.37 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1203  protein tyrosine phosphatase  27.86 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  31.3 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  27.4 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  29.46 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>