More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2803 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
269 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
255 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  42.74 
 
 
254 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
258 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  36.59 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  39.75 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 
225 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  35.47 
 
 
215 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
224 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
224 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
224 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  34.14 
 
 
225 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
144 aa  99.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
218 aa  99  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
229 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 
150 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
139 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  35.86 
 
 
151 aa  95.9  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.55 
 
 
143 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  36 
 
 
154 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  38.56 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  34.63 
 
 
228 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 
148 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.32 
 
 
140 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  43.8 
 
 
337 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  37.88 
 
 
125 aa  90.1  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  42.98 
 
 
144 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.91 
 
 
226 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  35.46 
 
 
141 aa  89  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  39.55 
 
 
142 aa  88.6  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  35.59 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.82 
 
 
146 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.44 
 
 
139 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.39 
 
 
270 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  40.35 
 
 
145 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  33.03 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.78 
 
 
152 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.97 
 
 
144 aa  85.5  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
142 aa  85.5  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  41.23 
 
 
142 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
144 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  37.31 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  43.1 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  37.68 
 
 
142 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  34.06 
 
 
133 aa  81.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  41.84 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.43 
 
 
139 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  35.18 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 
142 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
140 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  42.45 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.85 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.54 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.59 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.36 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  42.45 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.25 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 
138 aa  79  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 
138 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.41 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
143 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
168 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  41.61 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  32.84 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.44 
 
 
139 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  38.97 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 
165 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 
164 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.61 
 
 
139 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  37.84 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.29 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  37.96 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  43.55 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.74 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  45.13 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20630  protein-tyrosine-phosphatase  37.59 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.29 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  41.73 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.25 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  39.64 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  39.64 
 
 
140 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  39.64 
 
 
140 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.27 
 
 
588 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>