More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2810 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 229 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  63.96 
 
 		 228 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  67.31 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  63.96 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.37 
 
 		 226 aa  228  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  56.42 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  52.53 
 
 		 218 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  54.93 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  36.24 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  30.36 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2334  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.645667  normal  0.0775435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3819  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  33.58 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.19 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  34.62 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  31.3 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  38.02 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  28.46 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.2 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  32.59 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  29.6 
 
 		 125 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  36.13 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  32.09 
 
 		 142 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  36.75 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  27.64 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  27.64 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.45 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.6 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  31.71 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  34.4 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  32.12 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.94 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  40.19 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.93 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  33.33 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  26.91 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  30.19 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  28.46 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.85 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  30.2 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.19 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.26 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  32.81 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  34.29 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  30.97 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  34.03 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.14 
 
 		 152 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  28.7 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  32.12 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.46 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  32.33 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.59 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  32.43 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  30.66 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  28.99 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0227  protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  31.16 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  29.93 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  31.48 
 
 		 498 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  28.78 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  29.5 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.16 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  33.93 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.8 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2184  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.94 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000653418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1009  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.96 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  29.27 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  30.23 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  31.58 
 
 		 165 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  30.58 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.82 
 
 		 139 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>