More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5093 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
225 aa  447  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  76.89 
 
 
225 aa  345  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
224 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
224 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
224 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 
228 aa  228  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  55.41 
 
 
228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  57.89 
 
 
218 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.22 
 
 
226 aa  218  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  54.5 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  56.42 
 
 
229 aa  211  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  37.78 
 
 
254 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
258 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
269 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  31.02 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  31.98 
 
 
270 aa  85.1  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.41 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  38.17 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.81 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  30.77 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  37.41 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  28.87 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  34.07 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  39.85 
 
 
139 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  33.85 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  36.61 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.35 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  36.59 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  31.88 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  37.12 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  29.57 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  38.18 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  29.45 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.4 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.91 
 
 
152 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 
142 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  36.3 
 
 
163 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.59 
 
 
139 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.13 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 
163 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  38.18 
 
 
142 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  36.36 
 
 
158 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  30.71 
 
 
298 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
179 aa  62.8  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  33.56 
 
 
306 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  33.63 
 
 
138 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 
169 aa  62  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  37.23 
 
 
154 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.81 
 
 
140 aa  61.6  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  32.82 
 
 
164 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.77 
 
 
138 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  29.71 
 
 
150 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.65 
 
 
168 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  36.51 
 
 
141 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  30.99 
 
 
144 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
144 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  35.78 
 
 
142 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  35.2 
 
 
168 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  35.83 
 
 
164 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  36.36 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  30.16 
 
 
131 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  37.25 
 
 
144 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
151 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  31.45 
 
 
134 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  31.45 
 
 
134 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.76 
 
 
177 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.81 
 
 
175 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  31.75 
 
 
134 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  27.86 
 
 
145 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.56 
 
 
175 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  29.01 
 
 
148 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
171 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  33.85 
 
 
498 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  32.73 
 
 
142 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  30.95 
 
 
134 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 
160 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  30.95 
 
 
134 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  33.9 
 
 
165 aa  58.5  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  30.95 
 
 
134 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  36.57 
 
 
171 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  30.37 
 
 
139 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  26.4 
 
 
309 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  31.45 
 
 
134 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
164 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>