More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3344 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 218 aa  427  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  56.94 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  57.89 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  57.49 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  53.02 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.21 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 269 aa  99  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  35.27 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  35.2 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 270 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  34.41 
 
 		 270 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  38.17 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  39.69 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  30.42 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  38.17 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  27.69 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  37.4 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  31.54 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.09 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  37.21 
 
 		 498 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 276 aa  68.2  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2811  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  35.38 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.956828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1794  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.85 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3426  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  35.38 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328132  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  32.85 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  37.3 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5379  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  34.44 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  32.31 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.74 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  32.52 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8607  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.40475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  30.74 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  37.5 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  40.57 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.33 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  36.54 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.54 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1443  protein tyrosine phosphatase  29.94 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  28.37 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  41.58 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  28.68 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 258 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 150 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  39.81 
 
 		 164 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.4 
 
 		 165 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3654  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.07 
 
 		 150 aa  62  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 168 aa  62  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  33.83 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.82 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.59 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  39.05 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  31.06 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.28 
 
 		 139 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1554  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.89 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.62 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0214543  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  27.13 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  27.13 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  37.38 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  37.4 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.85 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.81 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0387  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.54 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  32.54 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.47 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0224  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.15 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.13 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.71 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.88 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.84 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.54 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.98 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>