More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3428 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3428  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3539  transcriptional regulator, ArsR family  82.46 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  77.67 
 
 		 215 aa  331  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  63.96 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  55.56 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  56.94 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  53.6 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  53.6 
 
 		 224 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  53.6 
 
 		 224 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.76 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  54.42 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  34.91 
 
 		 254 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  34.93 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  33.61 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  32.72 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  40.56 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.11 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  38.35 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.64 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.85 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.29 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.98 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  36.59 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.64 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.96 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35100  arsenate reductase  34.35 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  30.08 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0819  radical SAM family protein  33.06 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3666  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  33.88 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  34.78 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1219  protein tyrosine phosphatase  31.5 
 
 		 138 aa  62  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 		 164 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.31 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.94 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  33.06 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2962  arsenate reductase  37.39 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  35.82 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2860  arsenate reductase  35.9 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.796184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.77 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  35.77 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2481  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  31.34 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.19 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  27.99 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.44 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  29.92 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  29.92 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0355  protein tyrosine phosphatase  27.2 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  34.19 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  33.86 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  34.19 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3819  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2334  protein tyrosine phosphatase  32.86 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.645667  normal  0.0775435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  31.11 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  30.37 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  31.34 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  34.26 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  32.58 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  31.82 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0533  arsenate reductase, putative  34.31 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  32.48 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.54 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.84 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  31.15 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0585  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.94 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  38.39 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  34.29 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  35.16 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2716  arsenate reductase  34.09 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3036  protein tyrosine phosphatase  34.09 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  36.03 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  35.29 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>