More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3586 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3586  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.990464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2769  protein tyrosine phosphatase  53.57 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0899  protein tyrosine phosphatase  51.01 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  50.36 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5020  protein tyrosine phosphatase  49.32 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.23 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4415  protein tyrosine phosphatase  49.65 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4348  protein tyrosine phosphatase  50.35 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217616  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0641  hypothetical protein  48.67 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4277  protein tyrosine phosphatase  48.59 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0249  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.15 
 
 		 170 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0288  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1937  protein tyrosine phosphatase  47.89 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  48.28 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4792  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.52 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.604155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0269  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.37 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2259  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.18 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1982  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.18 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0210  protein tyrosine phosphatase  46.76 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0241  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0147469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2636  protein tyrosine phosphatase  47.26 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0880058  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2881  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3514  protein tyrosine phosphatase  46.53 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1957  protein tyrosine phosphatase  45.7 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33495  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0188  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0523  protein tyrosine phosphatase  48.25 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0595  protein tyrosine phosphatase  42.57 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3561  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188074 
 
 
-
 
NC_004310  BR0250  protein phosphatase, putative  43.26 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.262122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0268  putative protein phosphatase  43.26 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000694768  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2282  protein tyrosine phosphatase  41.5 
 
 		 161 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.307537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0630  hypothetical protein  41.5 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0324  protein tyrosine phosphatase  43.26 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0981  protein tyrosine phosphatase  39.04 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.784377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1129  protein tyrosine phosphatase  35.21 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0691501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.27 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  35.51 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.19 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.35 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  33.09 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.33 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.29 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.09 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.93 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 169 aa  67  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  34.53 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.34 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  32.33 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  31.3 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.2 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  32.33 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  30.23 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  34.35 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  29.1 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.58 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  36.64 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  31.91 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.89 
 
 		 588 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.08 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  27.27 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  36.78 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  30.15 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  30.82 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.15 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  30.15 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.15 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  32.54 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.47 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.17 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  32.61 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  30.19 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.11 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  29.08 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 269 aa  57.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  33.83 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  28.26 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3425  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.38 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  28.89 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4719  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.09 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.26 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  35.78 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  29.29 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>