More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2602 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
138 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  45.33 
 
 
140 aa  118  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.52 
 
 
140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  39.24 
 
 
164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.07 
 
 
138 aa  111  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.71 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  40.67 
 
 
140 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.19 
 
 
143 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  40.41 
 
 
132 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  41.06 
 
 
139 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  38.22 
 
 
147 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  36.31 
 
 
148 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  37.18 
 
 
150 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.33 
 
 
137 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  36.31 
 
 
148 aa  97.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  39.49 
 
 
145 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.42 
 
 
137 aa  95.9  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
143 aa  95.9  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  36.91 
 
 
154 aa  96.3  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  36.42 
 
 
139 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
145 aa  94  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
144 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  35.53 
 
 
138 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  34.9 
 
 
144 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  34.84 
 
 
146 aa  90.5  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
142 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 
151 aa  89  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32 
 
 
139 aa  89  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 
144 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  34.87 
 
 
143 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
144 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
143 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  32.9 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.64 
 
 
138 aa  85.9  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.53 
 
 
139 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  34.39 
 
 
142 aa  85.5  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
142 aa  84.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  34.81 
 
 
141 aa  84.7  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  37.91 
 
 
144 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  31.82 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.77 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.12 
 
 
137 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0666  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  51.9 
 
 
133 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.12 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  36 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.41 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  33.56 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  34.19 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  35.04 
 
 
127 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 
140 aa  79  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3381  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  48.1 
 
 
130 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  33.76 
 
 
132 aa  79  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2722  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  48.1 
 
 
130 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  32.68 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
255 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  35.1 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  35.59 
 
 
138 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  35.59 
 
 
138 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.41 
 
 
142 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  35.86 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.67 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  36.05 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0666  protein tyrosine phosphatase  29.8 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.524497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.05 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  31.13 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  30.52 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  43.33 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  30.52 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  36.11 
 
 
588 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  32.69 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
257 aa  74.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.42 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.19 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3332  arsenate reductase, glutathione/glutaredoxin type  32.89 
 
 
131 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.31 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  34.69 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  32.69 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1233  protein tyrosine phosphatase  30.72 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3712  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  30.92 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.72 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  33.56 
 
 
498 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
258 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3072  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.48 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.89 
 
 
157 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  33.77 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  29.14 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>