203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6510 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  100 
 
 
267 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  36.27 
 
 
214 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  40.52 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  36.16 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  44.35 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  42.62 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  35.03 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  45.37 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  39.02 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  26.46 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  37.34 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  36.26 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  40.44 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.76 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 
154 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  32.88 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  38.74 
 
 
670 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.85 
 
 
194 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  36.45 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  33.94 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  30.48 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  25.97 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  36.45 
 
 
146 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  37.27 
 
 
173 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  31.48 
 
 
147 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  35.38 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
151 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0932  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 
157 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  38.61 
 
 
148 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
156 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  30.64 
 
 
145 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  37.06 
 
 
154 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  40 
 
 
148 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  41.58 
 
 
145 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  32.28 
 
 
153 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.79 
 
 
151 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  43.53 
 
 
144 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  35.19 
 
 
148 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.79 
 
 
151 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  38.18 
 
 
148 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 
148 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  31.4 
 
 
145 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
153 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.79 
 
 
151 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0011  protein tyrosine phosphatase  39.52 
 
 
204 aa  58.9  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.92 
 
 
146 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  39 
 
 
156 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  37.76 
 
 
146 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.92 
 
 
146 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
151 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.73 
 
 
146 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35 
 
 
146 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35 
 
 
146 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 
182 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  36.19 
 
 
149 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 
146 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  35.85 
 
 
162 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
147 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  35.51 
 
 
148 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  28.21 
 
 
150 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.82 
 
 
383 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0950  protein tyrosine phosphatase  39.56 
 
 
124 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.91 
 
 
145 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 
146 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35 
 
 
146 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  32.74 
 
 
168 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 
150 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  36.19 
 
 
145 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0500  protein tyrosine phosphatase  41.05 
 
 
137 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0570993  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  29.82 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.96 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.96 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  24.78 
 
 
154 aa  53.9  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  29.6 
 
 
184 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.96 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.96 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.96 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  34.31 
 
 
146 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  33.96 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.96 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  36.19 
 
 
171 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  25.45 
 
 
228 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  28.32 
 
 
186 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  36.21 
 
 
182 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2151  protein tyrosine phosphatase  28.38 
 
 
139 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.38 
 
 
139 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  30.57 
 
 
147 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  37.61 
 
 
144 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  31.13 
 
 
147 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2681  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40 
 
 
136 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00909873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 
175 aa  52.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  27.68 
 
 
159 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.61 
 
 
148 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  38.3 
 
 
174 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 
158 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  39.53 
 
 
144 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  30.19 
 
 
145 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>