More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6746 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
156 aa  317  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  41.43 
 
 
144 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.88 
 
 
145 aa  111  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  42.65 
 
 
146 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  38.57 
 
 
144 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  39.6 
 
 
149 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  34.29 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 
144 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  32.62 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  31.91 
 
 
143 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  40.71 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.71 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 
164 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.09 
 
 
146 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.09 
 
 
146 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
147 aa  84  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  35.77 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.09 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  37.24 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  34.59 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  32.87 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.83 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  31.94 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.83 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  36.88 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.83 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.34 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  31.21 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.59 
 
 
383 aa  77.8  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  32.41 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  33.08 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  27.22 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  30.77 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.58 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.17 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  29.58 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  36.73 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.93 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  28.47 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  30.22 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  28.48 
 
 
322 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  26.49 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.62 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  38.6 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  33.05 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.82 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  35.82 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.88 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  29.08 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  31.2 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1059  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.07 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  35.56 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  33.57 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  27.74 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  30.28 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>