More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2149 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
157 aa  316  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  48.65 
 
 
154 aa  144  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  50.33 
 
 
156 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
153 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  40.67 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.57 
 
 
146 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  37.33 
 
 
154 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.89 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.33 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.67 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.61 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.61 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.61 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  34.23 
 
 
322 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  42 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  37.98 
 
 
147 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
148 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  40.25 
 
 
173 aa  100  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
168 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 
159 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  38.73 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.16 
 
 
383 aa  95.5  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  45.38 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  50.93 
 
 
228 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  43.67 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  36.24 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.18 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 
183 aa  84.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2393  protein tyrosine phosphatase  34.29 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.619492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  42.19 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  39.39 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  42.19 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  42.19 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  33.97 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1721  phosphotyrosine protein phosphatase  31.16 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  32.45 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  31.33 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  43.44 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  29.8 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  30.46 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  30.46 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  37.1 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  29.8 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  29.8 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  35.14 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  30.46 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  29.8 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.14 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  30.46 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  35.14 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  30.46 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.14 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  29.14 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.55 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.21 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  36.89 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  36.89 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  45.98 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  36.89 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.76 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  36.89 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  36.89 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1059  protein tyrosine phosphatase  36.77 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  36.89 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  36.89 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  36.89 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  30.92 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  29.8 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  50.6 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  43.02 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.32 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  45.88 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.48 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2151  protein tyrosine phosphatase  32.17 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.11 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  45.98 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>