More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3429 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
148 aa  306  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  75.68 
 
 
148 aa  236  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  51.43 
 
 
146 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  50.71 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  51.43 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  49.29 
 
 
146 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  48.57 
 
 
146 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 
146 aa  140  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  47.86 
 
 
146 aa  140  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  47.14 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  47.14 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  47.14 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  47.37 
 
 
154 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 
153 aa  129  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  45.75 
 
 
322 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  44.97 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 
156 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  45.27 
 
 
154 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  43.61 
 
 
147 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
159 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  39.58 
 
 
148 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  38 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
157 aa  96.7  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
173 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  40.44 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  38.31 
 
 
168 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  33.53 
 
 
183 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  41.41 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
228 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  38.28 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1721  phosphotyrosine protein phosphatase  32.86 
 
 
139 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21053  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  42.24 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  40.62 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.84 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.31 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2151  protein tyrosine phosphatase  34.31 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.86 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  33.8 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.84 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.99 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  32.88 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  35.94 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  33.82 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 
184 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  36.97 
 
 
147 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  35.9 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  32.04 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.79 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.86 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  34.69 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  34.33 
 
 
209 aa  70.1  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  34.96 
 
 
164 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.13 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  32.34 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.9 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  31.85 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  32.39 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6291  protein tyrosine phosphatase  35.38 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.33 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3078  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2401  protein tyrosine phosphatase  34.29 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  31.54 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  34.27 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  31.72 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  33.99 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  36.21 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  37.9 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.57 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  30.99 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  36.94 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.14 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  31.72 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  31.03 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  30.82 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  33.57 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>