More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5117 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 145 aa  290  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  57.24 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  52.48 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  47.86 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  46.85 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  49.28 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  47.89 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.18 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.18 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  52.48 
 
 		 150 aa  129  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  45.21 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  45.07 
 
 		 144 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  49.31 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  43.26 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  48.61 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  44.53 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  47.22 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  42.25 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  46.43 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  41.1 
 
 		 167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  40.94 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  42.36 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  43.06 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  43.66 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  43.66 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  43.66 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  43.66 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  43.66 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  43.66 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  43.66 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4242  protein tyrosine phosphatase  45.95 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  44.06 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.69 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  41.26 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  40.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  39.58 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  39.58 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  39.58 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  37.32 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  39.58 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  39.58 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  39.86 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  38.78 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.77 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  37.5 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.86 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.56 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  39.86 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.86 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 		 146 aa  97.1  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.43 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 154 aa  90.5  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 154 aa  89.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  34.93 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3725  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.353108 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5548  protein tyrosine phosphatase  36.3 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.93 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.58 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.89 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6291  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  36.91 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.58 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  39.58 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.58 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>