More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0258 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
168 aa  352  8.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
159 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 
156 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 
154 aa  111  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  36.08 
 
 
322 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  38.31 
 
 
154 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  41.29 
 
 
153 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
157 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  32.9 
 
 
173 aa  95.5  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  32.75 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
228 aa  92.8  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  36.13 
 
 
146 aa  92.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  38.31 
 
 
148 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  34.84 
 
 
148 aa  92  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 
147 aa  91.3  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.84 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.84 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.62 
 
 
146 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.97 
 
 
146 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  34.84 
 
 
146 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.84 
 
 
146 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  34.84 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  35.03 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  32.17 
 
 
144 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.55 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  31.61 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.9 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.37 
 
 
383 aa  80.9  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1721  phosphotyrosine protein phosphatase  33.76 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21053  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  32.87 
 
 
144 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  30.97 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  34.42 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  25.12 
 
 
209 aa  73.9  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  27.27 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.87 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2151  protein tyrosine phosphatase  34.87 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  31.41 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  29.41 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  32.19 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  32.26 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  28.76 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.32 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  32.87 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  32.05 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  29.53 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  29.68 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2337  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.45 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  30.52 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  30.94 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  30.97 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  27.74 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.32 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  31.21 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  34.88 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  32.81 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.32 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2040  protein tyrosine phosphatase  27.59 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000170102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  28.68 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  27.7 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  28.3 
 
 
695 aa  65.1  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  27.74 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  29.77 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  28.26 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  32.81 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  31.62 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  27.54 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  28.68 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  29.22 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  31.01 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  29.87 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.05 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  30.47 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  26.47 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 
167 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  31.37 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  29.61 
 
 
144 aa  60.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  28.76 
 
 
147 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  29.87 
 
 
186 aa  60.8  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  25.47 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  29.22 
 
 
143 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.46 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  27.27 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  28.76 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  28.37 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  25.33 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  31.08 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  28.76 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2393  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.619492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  28.76 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  29.22 
 
 
144 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>