More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0965 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0932  protein tyrosine phosphatase  56.76 
 
 
157 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  56.79 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  57.45 
 
 
154 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0950  protein tyrosine phosphatase  55.08 
 
 
124 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  39.23 
 
 
195 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  47.12 
 
 
207 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
214 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  36.16 
 
 
267 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  32.65 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  34.93 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  32.02 
 
 
263 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  31.14 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  42.73 
 
 
225 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  36.05 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  36.25 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  37.72 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  43.14 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  32.28 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  44.68 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 
228 aa  74.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  42.16 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  32.48 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  32.12 
 
 
322 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  30.59 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.14 
 
 
383 aa  70.9  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  30.59 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  38.61 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.93 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  32.39 
 
 
670 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  41.49 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.16 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  40.43 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  39.66 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  43.81 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  38.79 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  30.26 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  30.91 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  39.36 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  40.78 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  36.79 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  33.56 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  35.58 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  35.06 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  39.6 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1721  phosphotyrosine protein phosphatase  29.27 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21053  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.25 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  32.21 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  30.36 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4022  protein tyrosine phosphatase  31.09 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  30.57 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  29.25 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  35.29 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  32.21 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  29.05 
 
 
192 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.25 
 
 
151 aa  62  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  25.62 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  39.78 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  31.51 
 
 
148 aa  61.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 
150 aa  61.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  39.53 
 
 
175 aa  60.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 
144 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  29.88 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  30.87 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  30.77 
 
 
194 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  30.2 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.29 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>