More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3711 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
187 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  60.92 
 
 
178 aa  187  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  56.74 
 
 
164 aa  180  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  58.15 
 
 
188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  52.75 
 
 
182 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  48.3 
 
 
172 aa  150  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.86 
 
 
184 aa  149  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  49.11 
 
 
175 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  44.05 
 
 
158 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  44.77 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  47.93 
 
 
182 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  42.35 
 
 
183 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  44.19 
 
 
163 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  42.17 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  41.76 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  41.62 
 
 
196 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  42.51 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07350  protein-tyrosine-phosphatase  36.52 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  43.11 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  37.79 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 
154 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.57 
 
 
453 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  36.69 
 
 
161 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  39.53 
 
 
164 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  39.08 
 
 
165 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  39.08 
 
 
165 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  39.08 
 
 
165 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
152 aa  104  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  37.87 
 
 
154 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  37.87 
 
 
154 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  36.75 
 
 
160 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  37.13 
 
 
160 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  36.75 
 
 
160 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  37.87 
 
 
154 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  36.75 
 
 
160 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 
154 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  36.14 
 
 
160 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  38.79 
 
 
160 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.59 
 
 
157 aa  99  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 
154 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  34.68 
 
 
162 aa  98.6  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 
175 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  36.9 
 
 
165 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  36.75 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  35.96 
 
 
163 aa  95.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.97 
 
 
154 aa  95.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  35.93 
 
 
165 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  34.94 
 
 
160 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.28 
 
 
154 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  35.54 
 
 
165 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  34.12 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  27.75 
 
 
164 aa  90.5  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  32.77 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  37.71 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  31.93 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  28.48 
 
 
157 aa  89.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  34.13 
 
 
165 aa  88.6  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  36.54 
 
 
162 aa  88.6  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  32.12 
 
 
157 aa  87.8  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  32.94 
 
 
154 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  37.36 
 
 
167 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.97 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.97 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.97 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.97 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.97 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.97 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.97 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  27.54 
 
 
163 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  31.98 
 
 
158 aa  85.1  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  29.65 
 
 
166 aa  84.7  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
175 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  33.13 
 
 
155 aa  84.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  33.14 
 
 
154 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  30.54 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  35.03 
 
 
156 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  26.01 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.95 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  29.59 
 
 
166 aa  82  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  26.95 
 
 
154 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  34.18 
 
 
159 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  31.71 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.95 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  26.95 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.95 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  31.18 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.95 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.95 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  26.95 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  31.68 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1426  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  30.49 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01330  protein-tyrosine-phosphatase  37.72 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>