More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1941 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  62.86 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  52.48 
 
 		 144 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  53.9 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  51.77 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  52.48 
 
 		 144 aa  156  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  53.19 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  52.48 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  53.19 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  53.19 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  48.91 
 
 		 143 aa  146  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  50.35 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  47.45 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  49.29 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  46.81 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  49.65 
 
 		 148 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  49.65 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  48.95 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  51.08 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  43.97 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  46.85 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  46.72 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  47.79 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  47.14 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  46.43 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4242  protein tyrosine phosphatase  49.3 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1584  protein tyrosine phosphatase  45.83 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.310589  normal  0.519304 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  40 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  39.07 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  42.96 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  43.66 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  40.97 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  43.66 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.96 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  40.41 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  42.07 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  39.01 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  40.56 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  40.56 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.59 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  39.01 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  39.01 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  39.01 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  39.01 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  39.01 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  39.01 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  39.01 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  44.6 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  37.86 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.49 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  35.42 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 		 172 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  38.67 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  35.86 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.97 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001118  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  38.33 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00184775  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  31.72 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  46.79 
 
 		 228 aa  87  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  36.24 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 		 165 aa  86.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  31.72 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  32.39 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  31.72 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  31.72 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  31.72 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  31.69 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.69 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.69 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  37.42 
 
 		 166 aa  84.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3725  protein tyrosine phosphatase  32.41 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.353108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  37.9 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5548  protein tyrosine phosphatase  32.41 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  38.93 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2244  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452866  normal  0.673359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>