89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2393 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2393  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
142 aa  286  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.619492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  37.5 
 
 
322 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  38.24 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  34.29 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  42.2 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  33.09 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.17 
 
 
383 aa  77  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  29.71 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  30.34 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  33.04 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  36.59 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  35.65 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3078  protein tyrosine phosphatase  32.09 
 
 
292 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  33.62 
 
 
152 aa  60.1  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.59 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  31.21 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2401  protein tyrosine phosphatase  30.6 
 
 
279 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  27.41 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  33.91 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.33 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  33.59 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  33.64 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  33.64 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  32.17 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  30.3 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.85 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  30.84 
 
 
143 aa  58.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  34.17 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  30.3 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.11 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.11 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  30.33 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.11 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  33.04 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  34.18 
 
 
228 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  29.91 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  29.06 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2337  protein tyrosine phosphatase  32.28 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  32.99 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  29.03 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  28.97 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  29.86 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  27.55 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  30.43 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  26.47 
 
 
151 aa  50.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  33.64 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  29.27 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0932  protein tyrosine phosphatase  27.15 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  29.63 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  32.59 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  23.13 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  31.03 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  31.82 
 
 
147 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  29.57 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  29.57 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  28.7 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  26.96 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  26.61 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  31.36 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  28.57 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  28.57 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  25.25 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2875  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  25.4 
 
 
287 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.562148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1059  protein tyrosine phosphatase  26.32 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  38.24 
 
 
164 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  28.21 
 
 
166 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  28.89 
 
 
195 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0950  protein tyrosine phosphatase  33.73 
 
 
124 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  32.91 
 
 
132 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  27.55 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  28.23 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  28.41 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  31.08 
 
 
217 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  31.08 
 
 
217 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  31.08 
 
 
217 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>