More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1697 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
151 aa  318  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.92 
 
 
383 aa  113  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  37.41 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  36.49 
 
 
322 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 
156 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 
148 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 
154 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  35.44 
 
 
159 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  34.42 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  36.24 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  35.62 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.93 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  34.97 
 
 
148 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.25 
 
 
146 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 
153 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
152 aa  86.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  33.56 
 
 
146 aa  87  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.25 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 
163 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.56 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.56 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.25 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.56 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  34.03 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  35.37 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2393  protein tyrosine phosphatase  33.09 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.619492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10570  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01880)  42.71 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836007  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  31.51 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  32.64 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1596  protein tyrosine phosphatase  32.64 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483522  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1171  tyrosine phosphatase  32.64 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01956  hypothetical protein  32.64 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1580  tyrosine phosphatase  32.64 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.956744  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2354  tyrosine phosphatase  32.64 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1001  tyrosine phosphatase  32.64 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  32.64 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  31.25 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  29.8 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  29.61 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  30.07 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2040  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000170102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2675  tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.968561  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  33.94 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  28.48 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  26.92 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  29.25 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  38.79 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  39 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.57 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  33.57 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.57 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.57 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.57 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.57 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  33.57 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  33.57 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  30.22 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  30.46 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  28.47 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.08 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  32.62 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  31.11 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  33.1 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  27.21 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.56 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  30.86 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.85 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  30.92 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  29.17 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  28.48 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  40 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  29.86 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  30.28 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  25.17 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  30.14 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  31.75 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  30.82 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  28.95 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  30.95 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.43 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1957  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.692201  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  29.41 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  29.03 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  30.95 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  30.37 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>