More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3664 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
155 aa  306  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  76.16 
 
 
157 aa  216  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  76 
 
 
159 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  76 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  64.67 
 
 
156 aa  191  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1426  protein tyrosine phosphatase  68.63 
 
 
157 aa  190  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  71.43 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  62.91 
 
 
157 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3326  protein tyrosine phosphatase  64.47 
 
 
157 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4051  protein tyrosine phosphatase  63.76 
 
 
157 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00946919  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  60.67 
 
 
154 aa  160  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  59.87 
 
 
161 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0815  protein tyrosine phosphatase  58.7 
 
 
161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265223  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  52.94 
 
 
174 aa  141  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  42.48 
 
 
157 aa  130  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  48.67 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50.68 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  45.68 
 
 
166 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  48 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  48 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  46.79 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  48 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  52.24 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  48.28 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  47.33 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 
163 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 
158 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
162 aa  121  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.57 
 
 
154 aa  120  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.57 
 
 
154 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
158 aa  120  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.57 
 
 
154 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  42.57 
 
 
154 aa  120  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  42.57 
 
 
154 aa  120  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.57 
 
 
154 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.57 
 
 
154 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.57 
 
 
154 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  45.83 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  40.52 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  51.49 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 
182 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  47.65 
 
 
162 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.05 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.89 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  44 
 
 
158 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  47.76 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.06 
 
 
164 aa  116  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  41.78 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  38.31 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.4 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.4 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  39.19 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  48.67 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  43.31 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  45.58 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.4 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.4 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  47.4 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.75 
 
 
159 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.75 
 
 
159 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  51.16 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  44.59 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.4 
 
 
453 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  47.65 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44 
 
 
145 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
165 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  45.38 
 
 
158 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  42.67 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  40.12 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  48.23 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.52 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  43.88 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  41.5 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  43.15 
 
 
161 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
172 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.05 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  38.67 
 
 
150 aa  111  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 
155 aa  110  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.01 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.87 
 
 
159 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  42.48 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  44.97 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  45.04 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  43.24 
 
 
154 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  43.24 
 
 
154 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
154 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  40.82 
 
 
149 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  41.56 
 
 
154 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  35.95 
 
 
157 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 
154 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>