More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0006 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
155 aa  322  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  61.49 
 
 
150 aa  199  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  51.35 
 
 
155 aa  167  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7025  protein tyrosine phosphatase  52.11 
 
 
141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  44.81 
 
 
154 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  43.23 
 
 
173 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.16 
 
 
154 aa  134  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 
174 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  48.08 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.08 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  41.83 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.23 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  40.79 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.89 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  41.45 
 
 
201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  40.79 
 
 
201 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
173 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  40.54 
 
 
154 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  38.06 
 
 
160 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
162 aa  124  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  41.55 
 
 
154 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  42.04 
 
 
172 aa  124  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  41.56 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  45.7 
 
 
157 aa  123  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  47.55 
 
 
166 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  42.28 
 
 
157 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  40.26 
 
 
160 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  44.52 
 
 
154 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
163 aa  122  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
154 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
182 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  41.77 
 
 
166 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
154 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
167 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 
154 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  43.66 
 
 
154 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
171 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  41.83 
 
 
171 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.3 
 
 
157 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.21 
 
 
151 aa  120  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.49 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  38.22 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  36.71 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  44.06 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  40.52 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  38.99 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  41.78 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.06 
 
 
154 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.12 
 
 
159 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.52 
 
 
157 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  38.96 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.73 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.36 
 
 
154 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.36 
 
 
154 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.36 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  42.36 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  42.36 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.36 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.36 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.36 
 
 
154 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  41.45 
 
 
166 aa  116  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
163 aa  116  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  37.82 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  44.06 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  41.88 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  39.58 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  40.76 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  39.35 
 
 
159 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.45 
 
 
157 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  42.22 
 
 
159 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
157 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 
160 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.13 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 
453 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  39.74 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  38.26 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>